MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-3+10

Total Repeats: 244

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011720	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011720	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011720	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011720	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011720	TA	3	6	147	152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011720	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011720	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011720	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011720	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011720	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011720	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011720	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011720	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011720	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011720	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011720	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011720	AGC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011720	AAT	2	6	720	725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011720	TCT	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011720	T	6	6	752	757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011720	AAT	2	6	858	863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011720	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011720	AGG	2	6	934	939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011720	ATTA	2	8	947	954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011720	ATG	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011720	ATT	2	6	1051	1056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011720	GAA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011720	TAA	2	6	1244	1249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011720	GAG	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011720	ATT	2	6	1277	1282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011720	CAA	2	6	2089	2094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011720	ATT	2	6	2114	2119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011720	TA	3	6	5366	5371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011720	TAAAAA	2	12	5381	5392	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011720	AT	3	6	5679	5684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011720	TGA	2	6	5707	5712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011720	T	7	7	5729	5735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011720	TAA	2	6	5813	5818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011720	GCA	2	6	5821	5826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011720	A	6	6	5843	5848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011720	TCAA	2	8	5849	5856	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011720	TGA	2	6	5877	5882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011720	A	7	7	5882	5888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011720	AGGA	2	8	5921	5928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011720	CTAT	2	8	5933	5940	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011720	AATA	2	8	5949	5956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011720	TTA	2	6	6692	6697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011720	TAA	2	6	6709	6714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011720	TAA	2	6	6739	6744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011720	ATA	2	6	6749	6754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011720	TATT	2	8	6767	6774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011720	A	6	6	7134	7139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011720	A	6	6	7148	7153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011720	TA	3	6	7261	7266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011720	CTA	2	6	7932	7937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011720	ATA	2	6	7963	7968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011720	TAA	3	9	8014	8022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011720	A	7	7	8021	8027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011720	AT	3	6	8532	8537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011720	TCTT	2	8	8548	8555	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011720	T	7	7	8554	8560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011720	ATC	2	6	8638	8643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011720	T	7	7	8668	8674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011720	CAT	3	9	8739	8747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011720	TAT	2	6	8781	8786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011720	T	7	7	8786	8792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011720	T	6	6	8813	8818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011720	GTT	2	6	8887	8892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011720	T	7	7	8900	8906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011720	T	6	6	8922	8927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011720	CTTG	2	8	8952	8959	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011720	TTTTCG	2	12	8972	8983	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_011720	TAA	2	6	9285	9290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011720	ATT	2	6	9424	9429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011720	ATT	2	6	9442	9447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011720	T	6	6	9467	9472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011720	TAA	2	6	9489	9494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011720	TA	3	6	9502	9507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011720	T	6	6	9529	9534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011720	A	7	7	9549	9555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011720	TAT	2	6	9576	9581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011720	CTA	2	6	9582	9587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011720	T	7	7	9616	9622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011720	TGTAG	2	10	9678	9687	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011720	TAA	2	6	9757	9762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011720	T	7	7	9776	9782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011720	TAA	2	6	9820	9825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011720	ATT	2	6	9829	9834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011720	TAA	2	6	12251	12256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011720	T	6	6	13453	13458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011720	TGA	2	6	13479	13484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011720	TAT	2	6	13489	13494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011720	T	6	6	13543	13548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011720	TTTTA	2	10	13572	13581	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011720	ACAAAT	2	12	13582	13593	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_011720	AT	3	6	13615	13620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011720	ATT	2	6	13624	13629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011720	ATT	2	6	13645	13650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011720	TAA	2	6	13652	13657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011720	TTA	2	6	13681	13686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011720	AAT	2	6	13688	13693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011720	AT	8	16	13731	13746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011720	A	6	6	13761	13766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011720	CAATC	2	10	13784	13793	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_011720	TAAA	2	8	13830	13837	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011720	T	7	7	13846	13852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011720	A	6	6	13867	13872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011720	TA	3	6	13894	13899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011720	TATT	2	8	13904	13911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011720	AGG	2	6	13924	13929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011720	AAT	3	9	13954	13962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011720	CAA	2	6	14008	14013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011720	AAT	2	6	14031	14036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011720	TCT	2	6	14047	14052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011720	A	6	6	14063	14068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011720	AGT	2	6	14107	14112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011720	TTG	2	6	14204	14209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011720	TA	3	6	14288	14293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011720	AG	3	6	14329	14334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011720	ATA	2	6	14354	14359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011720	TA	3	6	14369	14374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011720	AAAT	2	8	14376	14383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011720	ATT	2	6	14408	14413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011720	A	7	7	14416	14422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011720	CAA	2	6	14450	14455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011720	TAA	3	9	14472	14480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011720	AGT	2	6	14530	14535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011720	T	6	6	14584	14589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011720	TGC	2	6	14665	14670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011720	TAA	2	6	14731	14736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011720	A	6	6	14762	14767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011720	AG	3	6	14786	14791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011720	TTG	2	6	14838	14843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011720	TAG	2	6	14850	14855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011720	AG	3	6	14854	14859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011720	GAGTT	2	10	14880	14889	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011720	AATC	2	8	14948	14955	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011720	A	7	7	15032	15038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011720	AGAT	2	8	15172	15179	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011720	ACT	2	6	15187	15192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011720	CAA	2	6	15195	15200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011720	TAGTGT	2	12	15241	15252	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011720	A	6	6	15274	15279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011720	A	7	7	15282	15288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011720	AGG	2	6	15301	15306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011720	ATTA	2	8	15307	15314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011720	AAGTAA	2	12	16557	16568	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011720	AGT	2	6	16666	16671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011720	CA	3	6	16706	16711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_011720	TG	3	6	16729	16734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011720	AT	3	6	16735	16740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011720	AATTT	2	10	16755	16764	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011720	TTA	2	6	16827	16832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011720	ATTA	2	8	16879	16886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011720	A	6	6	16898	16903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011720	ATT	2	6	16909	16914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_011720	GTT	2	6	17787	17792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_011720	AAAAG	2	10	17827	17836	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011720	TAG	2	6	17918	17923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_011720	ATT	2	6	19974	19979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_011720	TAA	2	6	19980	19985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_011720	AT	4	8	35028	35035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_011720	A	6	6	35044	35049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_011720	A	7	7	35531	35537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_011720	AAG	2	6	35591	35596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_011720	AAT	3	9	36343	36351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_011720	T	8	8	37366	37373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_011720	A	6	6	37376	37381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_011720	T	6	6	37382	37387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_011720	A	6	6	37390	37395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.